关于别构酶:
①别构酶的酶促反应大多不符合Michaelis-Menten动力学,即不符合米氏方程,其酶促反应曲线为S型(正协同)或双曲;
②效应物(别构剂)与调节亚基(调节部位)结合后导致酶构象的改变,引起酶催化部位的活性增加或降低;
③具活性中心和别构中心,且二中心处在酶蛋白的不同亚基或同一亚基的不同部位,即调节部位不同于催化部位;
④许多别构酶常处于代谢途径的起始部位或受控部位,代谢途径的终产物常作为别构酶的负效应物抑制这些酶;
⑤所有的别构酶均为寡聚酶;
⑥存在同促效应和异促效应:底物分子本身对别构酶的调节作用称同促效应;非底物分子对别构酶的调节作用称异促效应;
补充:为了区分符合米氏方程的酶和正协同效应的别构酶及负协同效应的别构酶,Koshland建议用协同指数(cooperativity index,CI)来鉴别不同的协同作用以及协同的程度。CI是指酶分子中的结合位点被底物饱和90%和饱和10%时底物浓度的比值。故协同指数又称饱和比值(Rs)。CI=Rs=81 1/n ,n为协同系数(Hill系数),存在下列不同的Rs值:
典型的米氏方程酶:Rs=81;
正协同效应的别构酶:Rs<81,且Rs愈小,正协同效应愈显著;
负协同效应的别构酶:Rs>81,且Rs愈大,负协同效应愈显著;
此外,也常用Hill系数来判断酶属于哪种类型:米氏方程酶n=1;正协同别构酶n>1;负协同别构酶n<1;
主要代谢途径酶系在细胞内的分布:
胞质:糖酵解,糖原合成,磷酸成糖途径,脂肪酸合成,部分蛋白质合成。
线粒体:脂肪酸β氧化,三羧酸循环,呼吸链,氧化磷酸化。
细胞核:核酸的合成、修饰。
内质网:蛋白质合成,磷脂合成。
胞质和线粒体:糖异生,胆固醇合成
溶酶体:多种水解酶
1.分布于细胞核的酶
核被膜 酸性磷酸酶
染色质 三磷酸核苷酶
核仁 核糖核酸酶
核内可溶性部分 酵解酶系、乳酸脱氢酶
2.分布于细胞质的酶
参与糖代谢的酶 酵解酶系 磷酸戊糖途径酶系
参与脂代谢的酶 脂肪酸合成酶复合体
参与a.a蛋白质的酶 Asp氨基转移酶
参与核酸合成的酶 核苷激酶 核苷酸激酶
3.分布于内质网的酶
光滑内质网 胆固醇合成酶系
粗糙内质网 蛋白质合成酶系
(细胞质一侧)
4.分布于线粒体的酶
外膜:酰基辅酶A合成酶
内膜:NADH脱氢酶
基质:三羧酸循环酶系 脂肪酸β-氧化酶系
5.分布于溶酶体的酶
水解蛋白质的酶水解糖苷类的酶水解核酸的酶水解脂类的酶
6.标志酶 有些酶只分布于细胞内某种特定的组分中,
核: 尼克酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶,功能:DNA、RNA生物合成
线粒体:琥珀酸脱氢酶(电子转移、三羧酸循环)
溶酶体:酸性磷酸酶(细胞成分的水解)
微粒体:(核蛋白体、多核蛋白体、内质网)Glc-6-磷酸酶
上清液:乳酸脱氢酶
真核与原核蛋白质合成的异同
真核 原核
核蛋白体 80S 70S
含蛋白数量 多于80 少于60
小亚基结构 无嘧啶区和互补区 含嘧啶区与互补
tRNA tRNAimet tRNAfmet
启动 eIF 9-10种 需ATP 小亚基先与tRNA结合,在与mRNA结合
延长 EF1,EF2 EFTu EFTs
终止 RF需GTP RF1,RF2,RF3
氨基酸的重要化学反应
反应基团 试剂 主要产物 应用P
α-NH2茚三酮 紫色、红色物 对氨基酸显色63
α=NH2茚三酮 黄色物Pro的鉴定
α-NH2 HNO2 N2等 游离aa定量,蛋白质水解程度59
α-NH2 DNFB二硝基氟苯Sanger试剂DNP-aa二硝基苯黄色物 蛋白质N端测定一级结构分析标准图谱6181
α-NH2 PITC苯异硫氰酸酯Edman试剂PTC-aa在无水的酸中环化成PTH-aa蛋白质N端测定一级结构分析aa顺序自动分析仪标准图谱82
α-NH2甲醛 羟甲基-aa和二羟甲基-aa甲醛滴定aa含量(封闭氨基)60
Arg的胍基 α-萘酚次溴酸钠坂口试剂 桃红色物 鉴定Arg
Met的-S-CH3 H2O2过氧化物 吸烟有害,烟中的过氧化物,弹性蛋白酶,抑制剂Met,肺气肿。
Cys的-SH碘代乙酸ICH2COOH过甲酸HCOOOH乙酸硫基HOOC-CH2-S-磺基HS3O-肽链拆分,作用与CYSS上的二硫键65
His的咪唑基 重氮苯磺酸Pauly试剂 樱红色物(1His连2重)鉴定His 65-66
Tyr的酚基 重氮苯磺酸Pauly试剂 桔黄色物 鉴定Tyr
Tyr的酚基 磷钼酸、磷钨酸Folin试剂 兰色物质 定量测定蛋白质、Tyr
Trp的吲哚基 对二甲基氨基苯甲醛兰色物质 鉴定Trp
-OHSer、Thr、Tyr激酶、ATP P-aa调节酶的活性,测定酶的活性中心65
蛋白质的颜色反应:可以用来定量定性测定蛋白质
双缩脲反应:红色,λm=540nm
黄色反应:与HNO3的反应,生成硝基苯,呈黄色。皮肤遇到HNO3的情况,白→黄→橙黄。
米伦氏反应:与HgNO3或HgNO2的反应,呈黄色,原理同上。
与乙醛酸的反应:红色,Trp的吲哚基的特定反应。
坂口反应:红色,Arg的胍基的反应。
福林反应:蓝色,是Tyr的酚基与磷钼酸和磷钨酸的反应。
印三酮反应:紫红色
Pauly反应:樱红色,His的咪唑基